Setelah dibersihkan dan didesinfeksi sebelum digunakan, bersih atau tidaknya cawan petri sangat berpengaruh terhadap kerja yang dapat mempengaruhi pH media kultur. Jika ada beberapa bahan kimia, itu akan menghambat pertumbuhan bakteri.
Cawan Petri yang baru dibeli sebaiknya dicuci dengan air panas terlebih dahulu, kemudian direndam dalam larutan asam klorida dengan fraksi massa 1 persen atau 2 persen selama beberapa jam untuk menghilangkan zat basa bebas, kemudian dicuci dua kali dengan air suling.
Jika Anda ingin membudidayakan bakteri, maka gunakan uap bertekanan tinggi (umumnya 6,8 * 10 daya PA uap bertekanan tinggi), sterilkan pada 120 derajat selama 30 menit, keringkan pada suhu kamar, atau sterilkan dengan panas kering, yaitu, letakkan kultur piring dalam oven dan simpan pada suhu sekitar 120 derajat selama 2 jam untuk membunuh gigi sel bakteri.
Hanya cawan Petri steril yang dapat diinokulasi dan dikultur.